Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a2O54833 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms