Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cops5O35864 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms