Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cited2O35740 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cited2O35740 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms