Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ppfibp2O35711 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ppfibp2O35711 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms