Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Opn1mwO35599 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Opn1mwO35599 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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