Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NmiO35309 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NmiO35309 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NmiO35309 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NmiO35309 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NmiO35309 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NmiO35309 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NmiO35309 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmiO35309 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmiO35309 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmiO35309 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NmiO35309 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NmiO35309 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms