Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm15708-201ENSMUST00000156467 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Eloc-206ENSMUST00000186948 641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC117797.1-201ENSMUST00000223977 695 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Scp2d1-201ENSMUST00000028918 760 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kctd1-201ENSMUST00000025992 1772 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm37886-201ENSMUST00000195349 1513 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm44093-201ENSMUST00000204381 1802 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Adgrb3-203ENSMUST00000126626 2953 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps28-201ENSMUST00000174767 942 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 AC154461.5-201ENSMUST00000225429 774 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Gm21887J3QQ04 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms