Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Gm21900J3QP38 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Gm21900J3QP38 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Gm21900J3QP38 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Gm21900J3QP38 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Gm21900J3QP38 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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