Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cldn34c2J3QNM1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cldn34c2J3QNM1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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