Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm21411J3KMS0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm21411J3KMS0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm21411J3KMS0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21411J3KMS0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm21411J3KMS0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm21411J3KMS0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm21411J3KMS0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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