Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pabpc4lG5E8X2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pabpc4lG5E8X2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms