Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r39G3UWE6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms