Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Srp72F8VQC1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp72F8VQC1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms