Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10477F6SW83 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10477F6SW83 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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