Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cald1E9QA15 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cald1E9QA15 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms