Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6W0

BC030500, cDNA sequence BC030500 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030500E9Q6W0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
BC030500E9Q6W0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
BC030500E9Q6W0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms