Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BC005561E9Q5E2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BC005561E9Q5E2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC005561E9Q5E2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms