Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn2r48E9Q5D8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn2r48E9Q5D8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms