Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ddx60E9PZQ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ddx60E9PZQ1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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