Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r177E9PXM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r177E9PXM3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms