Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Vpreb3D3Z6J4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vpreb3D3Z6J4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms