Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atp6ap1lD3Z5W0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms