Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc8D3YZV8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms