Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc170D3YXL0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc170D3YXL0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms