Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PtprbB2RU80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PtprbB2RU80 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms