Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Zscan5bB2RTN3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms