Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Brpf1B2RRD7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Brpf1B2RRD7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms