Protein–RNA interactions for Protein: B2RPV6

Mmrn1, Multimerin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmrn1B2RPV6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Mmrn1B2RPV6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmrn1B2RPV6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmrn1B2RPV6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmrn1B2RPV6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmrn1B2RPV6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Mmrn1B2RPV6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms