Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm2012B1B0R1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms