Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms