Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5W6

Ighv1-55, Immunoglobulin heavy variable 1-55 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-55A0A075B5W6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Ighv1-55A0A075B5W6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv1-55A0A075B5W6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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