Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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CAPN6Q9Y6Q1 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CAPN6Q9Y6Q1 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CAPN6Q9Y6Q1 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CAPN6Q9Y6Q1 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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CAPN6Q9Y6Q1 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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