Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CDKN3Q16667 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.7 ms