Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
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CCDC85BQ15834 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CCDC85BQ15834 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
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