Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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ITGA9Q13797 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ITGA9Q13797 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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