Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
TCOF1Q13428 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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