Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 RPL7P48-201ENST00000461513 746 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ARHGEF3Q9NR81 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms