Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms