Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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CCDC142Q17RM4 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CCDC142Q17RM4 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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