Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ITGA9-AS1-207ENST00000445429 532 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEC23BQ15437 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.65
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SEC23BQ15437 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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SEC23BQ15437 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEC23BQ15437 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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