Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 PDE4DIP-246ENST00000618462 8150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
RYR3Q15413 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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