Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ALCAMQ13740 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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