Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SMCO1Q147U7 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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