Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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TCOF1Q13428 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TCOF1Q13428 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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