Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
USP35Q9P2H5 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
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