Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR5B21-201ENST00000360374 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPL7AP30-201ENST00000482859 796 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC087565.2-201ENST00000637695 952 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
PHACTR1Q9C0D0 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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