Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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SYCP1Q15431 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
SYCP1Q15431 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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