Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
NEUROD1Q13562 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NEUROD1Q13562 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms