Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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TCIRG1Q13488 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
TCIRG1Q13488 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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