Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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